Ingénieur biologiste en analyse de données

de bac+3 à doctorat · ROME K2403 · Bac+5 (Master, diplôme d'ingénieur) requis, Bac+8 (Doctorat) fréquent

Aussi appelé : Bio-informaticien · Data scientist en biologie · Ingénieur en bioinformatique · Analyste de données biologiques · Computational biologist

Spécialités

génomique et NGSprotéomiquetranscriptomiquephylogénie et évolutionbiologie structuralemétabolomique

Ce métier permet de

R+T est prioritaire car le métier réussit d'abord quand la compréhension des phénomènes biologiques est atteinte (déchiffrer le sens caché dans les données génomiques), et cette compréhension passe obligatoirement par la manipulation technique des données et des algorithmes.

Où l’exerce-t-on

Recherche académique et fondamentale · 28 %Laboratoires publics de recherche fondamentale en génomique, biologie des systèmes, évolution…

Laboratoires publics de recherche fondamentale en génomique, biologie des systèmes, évolution moléculaire et développement de nouvelles méthodes d'analyse

Secteurs — Recherche publique, Enseignement supérieur, Instituts de recherche

Employeurs — CNRS, INSERM, INRAE, Instituts Pasteur, Universités

Pour commencer — Doctorant, Post-doctorant, Ingénieur de recherche junior, Bioinformaticien de laboratoire

Ensuite — Chargé de recherche, Directeur de recherche, Chef d'équipe bioinformatique, Professeur d'université

Biotechnologie et santé · 35 %Entreprises de biotechnologie, pharmaceutiques et medtech exploitant l'analyse de données pour…

Entreprises de biotechnologie, pharmaceutiques et medtech exploitant l'analyse de données pour la découverte de médicaments, le diagnostic et la médecine personnalisée

Secteurs — Industrie pharmaceutique, Biotechnologies, Diagnostic médical, Medtech

Employeurs — Sanofi, Servier, BioMérieux, Genfit, Owkin

Pour commencer — Bioinformaticien R&D, Analyste de données omiques, Ingénieur bioinformatique, Data scientist biologie

Ensuite — Lead bioinformaticien, Responsable plateforme bioinformatique, Directeur scientifique, Head of computational biology

Agronomie et environnement · 17 %Analyse de données génétiques pour l'amélioration des cultures, la surveillance…

Analyse de données génétiques pour l'amélioration des cultures, la surveillance environnementale, la biodiversité et la bioéconomie

Secteurs — Agroalimentaire, Semenciers, Recherche agronomique, Environnement

Employeurs — INRAE, Limagrain, Bayer CropScience, Lesaffre, CIRAD

Pour commencer — Bioinformaticien agro, Ingénieur analyse génomique, Data analyst biodiversité, Chercheur en génétique végétale

Ensuite — Responsable bioinformatique R&D, Expert génomique, Chef de projet innovation, Directeur scientifique agro

Services et conseil en data science biologique · 20 %Plateformes de séquençage, sociétés de conseil et startups proposant expertise et services…

Plateformes de séquençage, sociétés de conseil et startups proposant expertise et services d'analyse de données biologiques aux secteurs variés

Secteurs — Services B2B, Conseil scientifique, Plateformes technologiques, Startups

Employeurs — Eurofins Genomics, Genoscreen, Darwin Biosciences, Startups biotech, Accenture Life Sciences

Pour commencer — Consultant bioinformatique, Ingénieur d'application, Analyste de données client, Bioinformaticien support

Ensuite — Manager équipe bioinformatique, Consultant senior, Architecte solutions bio-data, Directeur technique

Le métier au quotidien

RythmeSoutenu mais flexible : deadlines de projets et publications, pics d'intensité lors d'analyses…

Soutenu mais flexible : deadlines de projets et publications, pics d'intensité lors d'analyses complexes, mais horaires généralement aménageables. Télétravail possible avec accès aux serveurs

AutonomieTrès élevée : gestion autonome des analyses, choix méthodologiques, organisation du temps de…

Très élevée : gestion autonome des analyses, choix méthodologiques, organisation du temps de travail. Liberté intellectuelle importante, surtout en recherche

InteractionsMoyennes mais qualitatives : collaboration étroite avec biologistes expérimentaux,…

Moyennes mais qualitatives : collaboration étroite avec biologistes expérimentaux, statisticiens, cliniciens. Réunions de projet régulières. Présentations scientifiques. Travail solitaire dominant devant écran

Environnement physiqueBureau et environnement informatique : travail sur ordinateurs puissants, parfois salles…

Bureau et environnement informatique : travail sur ordinateurs puissants, parfois salles serveurs. Écrans multiples, environnement calme. Occasionnellement laboratoire pour compréhension expériences

MobilitéVariable selon structure : conférences internationales fréquentes en académique, mobilité…

Variable selon structure : conférences internationales fréquentes en académique, mobilité limitée en industrie. Télétravail facilitant équilibre vie pro/perso. Mobilité géographique utile en début de carrière

Charge et pressionModéré à élevé : pression des deadlines projets et publications, complexité des analyses,…

Modéré à élevé : pression des deadlines projets et publications, complexité des analyses, frustration face aux données difficiles, enjeux scientifiques importants, mais pas d'urgence vitale comme en clinique

Évolution de carrièreExcellente : multiples trajectoires (académique, industrie, conseil), progression rapide avec…

Excellente : multiples trajectoires (académique, industrie, conseil), progression rapide avec expertise, reconversion facilitée vers data science, possibilité entrepreneuriat (biotech startups), formation continue accessible

Compétences

Techniques · 8Biologie moléculaire et génomique, Statistiques et modélisation mathématique, Programmation (Python, R, Java)…
Biologie moléculaire et génomiqueStatistiques et modélisation mathématiqueProgrammation (Python, R, Java)Algorithmique et machine learningBases de données biologiques (NCBI, UniProt, Ensembl)Séquençage NGS et analyse génomiqueVisualisation de données complexesConception de pipelines bioinformatiques
Transversales · 8Raisonnement analytique avancé, Résolution de problèmes complexes, Rigueur scientifique et méthodologique…
Raisonnement analytique avancéRésolution de problèmes complexesRigueur scientifique et méthodologiqueVeille scientifique et technologiqueRédaction scientifique en anglaisGestion de projets de rechercheEsprit de synthèseCapacité d'abstraction
Numériques · 8Maîtrise des environnements Linux/Unix, Langages de programmation scientifique, Outils de calcul haute performance (HPC)…
Maîtrise des environnements Linux/UnixLangages de programmation scientifiqueOutils de calcul haute performance (HPC)Bibliothèques ML (scikit-learn, TensorFlow)Git et gestion de versionsConteneurisation (Docker, Singularity)Systèmes de gestion de bases de donnéesNotebooks Jupyter et environnements collaboratifs

Ce que ce métier permet de développer

Se développer ●●●●●Apprentissage continu exceptionnel : veille permanente sur biologie et technologies data,…

Apprentissage continu exceptionnel : veille permanente sur biologie et technologies data, développement d'expertises pointues, stimulation intellectuelle constante, contribution à l'avancement des connaissances

Prendre des initiatives ●●●●○Autonomie importante dans l'approche analytique et le choix des méthodes, créativité dans…

Autonomie importante dans l'approche analytique et le choix des méthodes, créativité dans la modélisation, mais cadrage par les protocoles scientifiques et objectifs de projet

Agir sur le monde ●●●●○Contribution directe à des enjeux majeurs : santé (découverte médicaments, diagnostic),…

Contribution directe à des enjeux majeurs : santé (découverte médicaments, diagnostic), sécurité alimentaire, biodiversité, compréhension du vivant. Impact scientifique mesurable par publications

Stabilité économique ●●●●○Métier d'avenir avec forte demande, salaires attractifs en industrie, mais précarité…

Métier d'avenir avec forte demande, salaires attractifs en industrie, mais précarité possible en début de carrière académique (CDD post-doc). Reconversion facilitée vers data science généraliste

Marché de l’emploi

35 → 65 k€ par an

Tension au recrutementForte tension : profils très recherchés, pénurie de candidats combinant biologie et…

Forte tension : profils très recherchés, pénurie de candidats combinant biologie et compétences data avancées

Tendance du secteurTrès forte croissance : explosion des données omiques, développement de la médecine…

Très forte croissance : explosion des données omiques, développement de la médecine personnalisée, IA appliquée à la biologie, One Health, bioéconomie

Île-de-France (Paris-Saclay, Institut Pasteur, industrie pharma)Auvergne-Rhône-Alpes (Lyon, Grenoble : biotech et recherche)Occitanie (Toulouse : agronomie, biotech)Nouvelle-Aquitaine (Bordeaux : génomique)Grand Est (Strasbourg : recherche)

Parcours de formation

FormationDuréeNiveauParcoursup
Master Bioinformatique ou Bio-informatique5 ansBac+5oui
École d'ingénieurs avec spécialisation bioinformatique5 ansBac+5oui
Doctorat en Bioinformatique ou Biologie computationnelle8 ansBac+8
Double cursus Biologie-Informatique ou Mathématiques-Biologie5 ansBac+5oui